首先从地理位置上进行区分:高新西区位于成都市西北角、高新南区位于成都市正南方;
第二从行政区划上来区分,高新西区是整合了青羊区、郫都区(原郫县)的部分行政辖区而设立的,高新南区是整合了武侯区、双流区(原双流县)的部分行政辖区而设立的。